Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB4AP20338 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB4AP20338 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB4AP20338 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms