Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMY2BP19961 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMY2BP19961 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMY2BP19961 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMY2BP19961 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMY2BP19961 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMY2BP19961 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMY2BP19961 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AMY2BP19961 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AMY2BP19961 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMY2BP19961 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMY2BP19961 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMY2BP19961 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMY2BP19961 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms