Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
XRCC1P18887 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XRCC1P18887 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XRCC1P18887 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
XRCC1P18887 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XRCC1P18887 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XRCC1P18887 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XRCC1P18887 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XRCC1P18887 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XRCC1P18887 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
XRCC1P18887 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XRCC1P18887 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XRCC1P18887 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XRCC1P18887 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XRCC1P18887 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XRCC1P18887 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XRCC1P18887 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XRCC1P18887 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XRCC1P18887 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XRCC1P18887 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XRCC1P18887 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
XRCC1P18887 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XRCC1P18887 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XRCC1P18887 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XRCC1P18887 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XRCC1P18887 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XRCC1P18887 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
XRCC1P18887 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
XRCC1P18887 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XRCC1P18887 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
XRCC1P18887 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XRCC1P18887 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XRCC1P18887 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XRCC1P18887 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XRCC1P18887 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XRCC1P18887 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XRCC1P18887 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
XRCC1P18887 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XRCC1P18887 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XRCC1P18887 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XRCC1P18887 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XRCC1P18887 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XRCC1P18887 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XRCC1P18887 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms