Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF1P18846 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF1P18846 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF1P18846 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF1P18846 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF1P18846 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF1P18846 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF1P18846 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF1P18846 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF1P18846 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF1P18846 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF1P18846 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF1P18846 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF1P18846 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF1P18846 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF1P18846 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF1P18846 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF1P18846 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF1P18846 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF1P18846 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF1P18846 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF1P18846 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF1P18846 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF1P18846 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF1P18846 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF1P18846 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF1P18846 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF1P18846 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF1P18846 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF1P18846 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF1P18846 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF1P18846 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF1P18846 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF1P18846 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF1P18846 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF1P18846 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF1P18846 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF1P18846 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF1P18846 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF1P18846 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF1P18846 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF1P18846 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF1P18846 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF1P18846 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF1P18846 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF1P18846 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF1P18846 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF1P18846 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF1P18846 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF1P18846 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF1P18846 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF1P18846 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF1P18846 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF1P18846 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF1P18846 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF1P18846 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF1P18846 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF1P18846 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF1P18846 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF1P18846 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF1P18846 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF1P18846 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF1P18846 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF1P18846 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATF1P18846 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATF1P18846 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATF1P18846 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF1P18846 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF1P18846 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF1P18846 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF1P18846 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF1P18846 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF1P18846 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF1P18846 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF1P18846 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF1P18846 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF1P18846 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF1P18846 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF1P18846 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF1P18846 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF1P18846 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF1P18846 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF1P18846 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF1P18846 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF1P18846 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF1P18846 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF1P18846 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF1P18846 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF1P18846 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF1P18846 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF1P18846 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF1P18846 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF1P18846 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF1P18846 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF1P18846 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF1P18846 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF1P18846 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF1P18846 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF1P18846 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF1P18846 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms