Protein–RNA interactions for Protein: P17568

NDUFB7, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB7P17568 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB7P17568 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFB7P17568 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB7P17568 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB7P17568 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.5 ms