Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH1P12830 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDH1P12830 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDH1P12830 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH1P12830 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH1P12830 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH1P12830 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH1P12830 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH1P12830 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH1P12830 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH1P12830 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH1P12830 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH1P12830 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH1P12830 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH1P12830 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH1P12830 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH1P12830 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH1P12830 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH1P12830 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH1P12830 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH1P12830 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH1P12830 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH1P12830 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH1P12830 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH1P12830 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH1P12830 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH1P12830 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH1P12830 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH1P12830 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH1P12830 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH1P12830 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH1P12830 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH1P12830 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH1P12830 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH1P12830 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH1P12830 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH1P12830 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH1P12830 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH1P12830 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH1P12830 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH1P12830 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH1P12830 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH1P12830 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH1P12830 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH1P12830 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH1P12830 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH1P12830 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH1P12830 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH1P12830 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH1P12830 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH1P12830 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH1P12830 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH1P12830 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH1P12830 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH1P12830 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH1P12830 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH1P12830 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH1P12830 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH1P12830 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH1P12830 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH1P12830 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH1P12830 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH1P12830 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH1P12830 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH1P12830 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH1P12830 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH1P12830 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH1P12830 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH1P12830 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH1P12830 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDH1P12830 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDH1P12830 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH1P12830 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH1P12830 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH1P12830 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH1P12830 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH1P12830 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH1P12830 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH1P12830 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH1P12830 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH1P12830 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH1P12830 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH1P12830 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH1P12830 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH1P12830 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH1P12830 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH1P12830 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH1P12830 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH1P12830 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH1P12830 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH1P12830 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH1P12830 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH1P12830 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH1P12830 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH1P12830 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH1P12830 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH1P12830 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH1P12830 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH1P12830 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH1P12830 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms