Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RALAP11233 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RALAP11233 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RALAP11233 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RALAP11233 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RALAP11233 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RALAP11233 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RALAP11233 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RALAP11233 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RALAP11233 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RALAP11233 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RALAP11233 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RALAP11233 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RALAP11233 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RALAP11233 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RALAP11233 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RALAP11233 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RALAP11233 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RALAP11233 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RALAP11233 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RALAP11233 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RALAP11233 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RALAP11233 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RALAP11233 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RALAP11233 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RALAP11233 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RALAP11233 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RALAP11233 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RALAP11233 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RALAP11233 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RALAP11233 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RALAP11233 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RALAP11233 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RALAP11233 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RALAP11233 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RALAP11233 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RALAP11233 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RALAP11233 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RALAP11233 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RALAP11233 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RALAP11233 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RALAP11233 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RALAP11233 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RALAP11233 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RALAP11233 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RALAP11233 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RALAP11233 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RALAP11233 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RALAP11233 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RALAP11233 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RALAP11233 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RALAP11233 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RALAP11233 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RALAP11233 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RALAP11233 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RALAP11233 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RALAP11233 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RALAP11233 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RALAP11233 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RALAP11233 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RALAP11233 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RALAP11233 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RALAP11233 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RALAP11233 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RALAP11233 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RALAP11233 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RALAP11233 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RALAP11233 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RALAP11233 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RALAP11233 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RALAP11233 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RALAP11233 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RALAP11233 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RALAP11233 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RALAP11233 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RALAP11233 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RALAP11233 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RALAP11233 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RALAP11233 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RALAP11233 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RALAP11233 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RALAP11233 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RALAP11233 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RALAP11233 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RALAP11233 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RALAP11233 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RALAP11233 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RALAP11233 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RALAP11233 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RALAP11233 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RALAP11233 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RALAP11233 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RALAP11233 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RALAP11233 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RALAP11233 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RALAP11233 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RALAP11233 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RALAP11233 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RALAP11233 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RALAP11233 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms