Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX0

ZNF728, Zinc finger protein 728, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF728P0DKX0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF728P0DKX0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF728P0DKX0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF728P0DKX0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF728P0DKX0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF728P0DKX0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF728P0DKX0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF728P0DKX0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF728P0DKX0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF728P0DKX0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF728P0DKX0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF728P0DKX0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF728P0DKX0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF728P0DKX0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF728P0DKX0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF728P0DKX0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF728P0DKX0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF728P0DKX0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF728P0DKX0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF728P0DKX0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF728P0DKX0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF728P0DKX0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF728P0DKX0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF728P0DKX0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF728P0DKX0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF728P0DKX0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF728P0DKX0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF728P0DKX0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF728P0DKX0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF728P0DKX0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms