Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPR89BP0CG08 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPR89BP0CG08 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPR89BP0CG08 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPR89BP0CG08 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPR89BP0CG08 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPR89BP0CG08 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPR89BP0CG08 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GPR89BP0CG08 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPR89BP0CG08 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPR89BP0CG08 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPR89BP0CG08 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPR89BP0CG08 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPR89BP0CG08 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPR89BP0CG08 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPR89BP0CG08 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPR89BP0CG08 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPR89BP0CG08 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPR89BP0CG08 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPR89BP0CG08 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPR89BP0CG08 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPR89BP0CG08 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPR89BP0CG08 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPR89BP0CG08 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPR89BP0CG08 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPR89BP0CG08 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPR89BP0CG08 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPR89BP0CG08 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPR89BP0CG08 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GPR89BP0CG08 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPR89BP0CG08 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPR89BP0CG08 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPR89BP0CG08 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPR89BP0CG08 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPR89BP0CG08 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPR89BP0CG08 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPR89BP0CG08 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPR89BP0CG08 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPR89BP0CG08 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPR89BP0CG08 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms