Protein–RNA interactions for Protein: P08559

PDHA1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDHA1P08559 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDHA1P08559 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDHA1P08559 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDHA1P08559 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDHA1P08559 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDHA1P08559 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDHA1P08559 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDHA1P08559 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDHA1P08559 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDHA1P08559 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDHA1P08559 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDHA1P08559 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDHA1P08559 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDHA1P08559 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDHA1P08559 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDHA1P08559 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDHA1P08559 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDHA1P08559 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDHA1P08559 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDHA1P08559 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDHA1P08559 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDHA1P08559 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDHA1P08559 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PDHA1P08559 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms