Protein–RNA interactions for Protein: P07954

FH, Fumarate hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHP07954 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHP07954 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHP07954 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHP07954 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHP07954 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHP07954 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHP07954 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHP07954 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHP07954 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHP07954 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHP07954 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHP07954 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHP07954 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FHP07954 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FHP07954 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FHP07954 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FHP07954 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FHP07954 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FHP07954 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FHP07954 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FHP07954 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FHP07954 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FHP07954 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FHP07954 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FHP07954 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FHP07954 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FHP07954 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FHP07954 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FHP07954 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FHP07954 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FHP07954 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FHP07954 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FHP07954 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FHP07954 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
FHP07954 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FHP07954 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FHP07954 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FHP07954 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FHP07954 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FHP07954 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FHP07954 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FHP07954 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FHP07954 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FHP07954 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FHP07954 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FHP07954 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FHP07954 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FHP07954 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FHP07954 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FHP07954 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FHP07954 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FHP07954 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FHP07954 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FHP07954 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FHP07954 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FHP07954 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FHP07954 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FHP07954 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FHP07954 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FHP07954 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FHP07954 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FHP07954 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FHP07954 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FHP07954 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FHP07954 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FHP07954 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FHP07954 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FHP07954 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FHP07954 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FHP07954 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FHP07954 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FHP07954 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHP07954 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHP07954 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHP07954 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FHP07954 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHP07954 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHP07954 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHP07954 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHP07954 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHP07954 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FHP07954 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FHP07954 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FHP07954 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FHP07954 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FHP07954 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FHP07954 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FHP07954 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FHP07954 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FHP07954 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FHP07954 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FHP07954 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FHP07954 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FHP07954 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FHP07954 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FHP07954 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHP07954 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHP07954 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHP07954 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FHP07954 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms