Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KRT18P05783 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT18P05783 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KRT18P05783 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KRT18P05783 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KRT18P05783 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KRT18P05783 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KRT18P05783 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KRT18P05783 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KRT18P05783 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KRT18P05783 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KRT18P05783 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KRT18P05783 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KRT18P05783 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KRT18P05783 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KRT18P05783 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KRT18P05783 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KRT18P05783 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KRT18P05783 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KRT18P05783 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KRT18P05783 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KRT18P05783 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KRT18P05783 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KRT18P05783 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KRT18P05783 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT18P05783 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT18P05783 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT18P05783 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT18P05783 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT18P05783 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT18P05783 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT18P05783 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT18P05783 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT18P05783 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT18P05783 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT18P05783 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT18P05783 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT18P05783 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT18P05783 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT18P05783 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT18P05783 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT18P05783 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT18P05783 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT18P05783 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT18P05783 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT18P05783 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT18P05783 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT18P05783 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT18P05783 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT18P05783 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT18P05783 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT18P05783 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT18P05783 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT18P05783 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT18P05783 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT18P05783 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT18P05783 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT18P05783 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT18P05783 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT18P05783 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT18P05783 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT18P05783 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT18P05783 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT18P05783 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT18P05783 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT18P05783 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT18P05783 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT18P05783 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KRT18P05783 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT18P05783 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT18P05783 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT18P05783 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT18P05783 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT18P05783 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT18P05783 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT18P05783 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KRT18P05783 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KRT18P05783 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KRT18P05783 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KRT18P05783 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
KRT18P05783 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KRT18P05783 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KRT18P05783 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KRT18P05783 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KRT18P05783 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KRT18P05783 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KRT18P05783 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KRT18P05783 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KRT18P05783 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KRT18P05783 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT18P05783 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT18P05783 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT18P05783 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KRT18P05783 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KRT18P05783 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KRT18P05783 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT18P05783 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT18P05783 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT18P05783 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT18P05783 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms