Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG5P05408 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG5P05408 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG5P05408 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG5P05408 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG5P05408 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG5P05408 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG5P05408 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG5P05408 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG5P05408 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG5P05408 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG5P05408 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG5P05408 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCG5P05408 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCG5P05408 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG5P05408 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG5P05408 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG5P05408 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG5P05408 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCG5P05408 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCG5P05408 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG5P05408 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG5P05408 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG5P05408 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG5P05408 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG5P05408 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG5P05408 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG5P05408 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG5P05408 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCG5P05408 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCG5P05408 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SCG5P05408 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCG5P05408 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG5P05408 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG5P05408 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG5P05408 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG5P05408 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG5P05408 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG5P05408 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG5P05408 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG5P05408 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG5P05408 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG5P05408 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG5P05408 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG5P05408 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG5P05408 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG5P05408 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG5P05408 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG5P05408 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG5P05408 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG5P05408 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG5P05408 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG5P05408 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG5P05408 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG5P05408 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG5P05408 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG5P05408 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG5P05408 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG5P05408 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG5P05408 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG5P05408 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG5P05408 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG5P05408 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG5P05408 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG5P05408 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG5P05408 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG5P05408 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG5P05408 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG5P05408 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG5P05408 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG5P05408 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG5P05408 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG5P05408 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG5P05408 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG5P05408 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG5P05408 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG5P05408 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCG5P05408 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCG5P05408 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCG5P05408 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCG5P05408 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCG5P05408 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCG5P05408 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCG5P05408 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCG5P05408 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCG5P05408 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCG5P05408 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCG5P05408 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCG5P05408 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCG5P05408 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCG5P05408 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCG5P05408 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCG5P05408 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCG5P05408 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SCG5P05408 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCG5P05408 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCG5P05408 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCG5P05408 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCG5P05408 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCG5P05408 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms