Protein–RNA interactions for Protein: P01601

IGKV1D-16, Immunoglobulin kappa variable 1D-16 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-16P01601 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGKV1D-16P01601 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGKV1D-16P01601 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGKV1D-16P01601 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGKV1D-16P01601 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGKV1D-16P01601 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGKV1D-16P01601 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGKV1D-16P01601 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGKV1D-16P01601 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGKV1D-16P01601 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGKV1D-16P01601 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGKV1D-16P01601 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGKV1D-16P01601 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGKV1D-16P01601 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
IGKV1D-16P01601 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGKV1D-16P01601 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGKV1D-16P01601 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGKV1D-16P01601 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGKV1D-16P01601 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGKV1D-16P01601 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGKV1D-16P01601 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGKV1D-16P01601 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGKV1D-16P01601 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGKV1D-16P01601 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGKV1D-16P01601 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGKV1D-16P01601 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGKV1D-16P01601 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGKV1D-16P01601 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGKV1D-16P01601 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGKV1D-16P01601 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGKV1D-16P01601 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IGKV1D-16P01601 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGKV1D-16P01601 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGKV1D-16P01601 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGKV1D-16P01601 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IGKV1D-16P01601 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGKV1D-16P01601 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGKV1D-16P01601 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGKV1D-16P01601 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGKV1D-16P01601 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGKV1D-16P01601 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGKV1D-16P01601 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGKV1D-16P01601 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGKV1D-16P01601 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGKV1D-16P01601 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGKV1D-16P01601 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGKV1D-16P01601 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGKV1D-16P01601 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGKV1D-16P01601 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IGKV1D-16P01601 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGKV1D-16P01601 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGKV1D-16P01601 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGKV1D-16P01601 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGKV1D-16P01601 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms