Protein–RNA interactions for Protein: P01566

IFNA10, Interferon alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA10P01566 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA10P01566 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA10P01566 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA10P01566 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IFNA10P01566 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNA10P01566 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA10P01566 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA10P01566 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA10P01566 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA10P01566 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA10P01566 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA10P01566 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA10P01566 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA10P01566 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA10P01566 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA10P01566 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IFNA10P01566 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA10P01566 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA10P01566 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA10P01566 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA10P01566 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA10P01566 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA10P01566 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA10P01566 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA10P01566 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA10P01566 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA10P01566 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA10P01566 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA10P01566 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA10P01566 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA10P01566 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA10P01566 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA10P01566 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA10P01566 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA10P01566 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA10P01566 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA10P01566 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA10P01566 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNA10P01566 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA10P01566 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA10P01566 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA10P01566 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA10P01566 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA10P01566 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA10P01566 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA10P01566 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA10P01566 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA10P01566 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA10P01566 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA10P01566 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA10P01566 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms