Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYF2O95926 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYF2O95926 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYF2O95926 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYF2O95926 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYF2O95926 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYF2O95926 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYF2O95926 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYF2O95926 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYF2O95926 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYF2O95926 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYF2O95926 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYF2O95926 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYF2O95926 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYF2O95926 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYF2O95926 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYF2O95926 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYF2O95926 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYF2O95926 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYF2O95926 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SYF2O95926 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYF2O95926 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYF2O95926 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYF2O95926 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYF2O95926 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYF2O95926 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYF2O95926 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYF2O95926 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYF2O95926 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYF2O95926 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYF2O95926 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYF2O95926 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYF2O95926 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYF2O95926 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYF2O95926 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYF2O95926 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYF2O95926 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYF2O95926 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYF2O95926 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYF2O95926 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SYF2O95926 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYF2O95926 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYF2O95926 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYF2O95926 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYF2O95926 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYF2O95926 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYF2O95926 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYF2O95926 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYF2O95926 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYF2O95926 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYF2O95926 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYF2O95926 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYF2O95926 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYF2O95926 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYF2O95926 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYF2O95926 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYF2O95926 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYF2O95926 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYF2O95926 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SYF2O95926 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYF2O95926 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYF2O95926 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYF2O95926 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYF2O95926 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYF2O95926 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYF2O95926 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYF2O95926 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYF2O95926 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYF2O95926 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYF2O95926 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYF2O95926 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYF2O95926 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYF2O95926 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYF2O95926 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYF2O95926 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYF2O95926 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYF2O95926 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SYF2O95926 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYF2O95926 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYF2O95926 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYF2O95926 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYF2O95926 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYF2O95926 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYF2O95926 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYF2O95926 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYF2O95926 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYF2O95926 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYF2O95926 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYF2O95926 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYF2O95926 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYF2O95926 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYF2O95926 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYF2O95926 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYF2O95926 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYF2O95926 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYF2O95926 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYF2O95926 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYF2O95926 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYF2O95926 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYF2O95926 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms