Protein–RNA interactions for Protein: O95727

CRTAM, Cytotoxic and regulatory T-cell molecule, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAMO95727 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRTAMO95727 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRTAMO95727 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRTAMO95727 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRTAMO95727 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRTAMO95727 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRTAMO95727 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRTAMO95727 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRTAMO95727 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRTAMO95727 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRTAMO95727 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRTAMO95727 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRTAMO95727 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRTAMO95727 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRTAMO95727 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRTAMO95727 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRTAMO95727 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRTAMO95727 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRTAMO95727 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRTAMO95727 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRTAMO95727 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRTAMO95727 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRTAMO95727 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRTAMO95727 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRTAMO95727 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRTAMO95727 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CRTAMO95727 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRTAMO95727 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRTAMO95727 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRTAMO95727 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CRTAMO95727 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRTAMO95727 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRTAMO95727 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRTAMO95727 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CRTAMO95727 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRTAMO95727 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRTAMO95727 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRTAMO95727 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CRTAMO95727 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRTAMO95727 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRTAMO95727 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRTAMO95727 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRTAMO95727 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRTAMO95727 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRTAMO95727 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRTAMO95727 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRTAMO95727 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRTAMO95727 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CRTAMO95727 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRTAMO95727 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRTAMO95727 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRTAMO95727 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRTAMO95727 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRTAMO95727 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRTAMO95727 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRTAMO95727 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRTAMO95727 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CRTAMO95727 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms