Protein–RNA interactions for Protein: O95264

HTR3B, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3BO95264 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR3BO95264 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR3BO95264 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR3BO95264 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR3BO95264 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR3BO95264 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR3BO95264 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR3BO95264 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR3BO95264 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR3BO95264 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR3BO95264 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR3BO95264 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR3BO95264 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR3BO95264 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR3BO95264 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR3BO95264 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR3BO95264 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR3BO95264 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR3BO95264 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR3BO95264 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR3BO95264 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms