Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC45.93■■■■■ 4.94
SOGA1O94964 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC45.91■■■■■ 4.94
SOGA1O94964 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
SOGA1O94964 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
SOGA1O94964 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.94
SOGA1O94964 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
SOGA1O94964 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
SOGA1O94964 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.86■■■■■ 4.93
SOGA1O94964 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.86■■■■■ 4.93
SOGA1O94964 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
SOGA1O94964 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC45.84■■■■■ 4.93
SOGA1O94964 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
SOGA1O94964 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
SOGA1O94964 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
SOGA1O94964 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
SOGA1O94964 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
SOGA1O94964 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
SOGA1O94964 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
SOGA1O94964 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC45.82■■■■■ 4.93
SOGA1O94964 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
SOGA1O94964 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
SOGA1O94964 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC45.79■■■■■ 4.92
SOGA1O94964 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
SOGA1O94964 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC45.77■■■■■ 4.92
SOGA1O94964 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
SOGA1O94964 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
SOGA1O94964 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
SOGA1O94964 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
SOGA1O94964 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
SOGA1O94964 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
SOGA1O94964 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
SOGA1O94964 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
SOGA1O94964 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
SOGA1O94964 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
SOGA1O94964 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
SOGA1O94964 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
SOGA1O94964 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC45.67■■■■■ 4.9
SOGA1O94964 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
SOGA1O94964 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
SOGA1O94964 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
SOGA1O94964 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
SOGA1O94964 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
SOGA1O94964 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
SOGA1O94964 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
SOGA1O94964 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
SOGA1O94964 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
SOGA1O94964 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
SOGA1O94964 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
SOGA1O94964 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
SOGA1O94964 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.89
SOGA1O94964 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
SOGA1O94964 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC45.55■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.51■■■■■ 4.88
SOGA1O94964 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
SOGA1O94964 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
SOGA1O94964 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
SOGA1O94964 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
SOGA1O94964 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
SOGA1O94964 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC45.44■■■■■ 4.87
SOGA1O94964 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
SOGA1O94964 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
SOGA1O94964 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
SOGA1O94964 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
SOGA1O94964 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
SOGA1O94964 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
SOGA1O94964 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
SOGA1O94964 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
SOGA1O94964 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
SOGA1O94964 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
SOGA1O94964 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
SOGA1O94964 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
SOGA1O94964 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
SOGA1O94964 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
SOGA1O94964 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
SOGA1O94964 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
SOGA1O94964 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC45.29■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC45.28■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms