Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALDH1A2O94788 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALDH1A2O94788 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALDH1A2O94788 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALDH1A2O94788 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALDH1A2O94788 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALDH1A2O94788 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALDH1A2O94788 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALDH1A2O94788 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALDH1A2O94788 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALDH1A2O94788 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALDH1A2O94788 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALDH1A2O94788 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ALDH1A2O94788 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALDH1A2O94788 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALDH1A2O94788 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALDH1A2O94788 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALDH1A2O94788 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALDH1A2O94788 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALDH1A2O94788 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1A2O94788 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1A2O94788 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1A2O94788 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1A2O94788 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1A2O94788 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1A2O94788 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1A2O94788 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1A2O94788 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1A2O94788 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALDH1A2O94788 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALDH1A2O94788 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALDH1A2O94788 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A2O94788 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A2O94788 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A2O94788 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A2O94788 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A2O94788 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALDH1A2O94788 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALDH1A2O94788 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALDH1A2O94788 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALDH1A2O94788 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALDH1A2O94788 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ALDH1A2O94788 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ALDH1A2O94788 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ALDH1A2O94788 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALDH1A2O94788 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALDH1A2O94788 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALDH1A2O94788 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALDH1A2O94788 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms