Protein–RNA interactions for Protein: O75818

RPP40, Ribonuclease P protein subunit p40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPP40O75818 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPP40O75818 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPP40O75818 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPP40O75818 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPP40O75818 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPP40O75818 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPP40O75818 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPP40O75818 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPP40O75818 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPP40O75818 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPP40O75818 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPP40O75818 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPP40O75818 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPP40O75818 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPP40O75818 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RPP40O75818 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPP40O75818 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPP40O75818 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPP40O75818 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPP40O75818 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPP40O75818 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPP40O75818 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPP40O75818 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPP40O75818 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPP40O75818 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPP40O75818 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPP40O75818 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RPP40O75818 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPP40O75818 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPP40O75818 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPP40O75818 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPP40O75818 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPP40O75818 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPP40O75818 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPP40O75818 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPP40O75818 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPP40O75818 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPP40O75818 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPP40O75818 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPP40O75818 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPP40O75818 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPP40O75818 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPP40O75818 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPP40O75818 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPP40O75818 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPP40O75818 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPP40O75818 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPP40O75818 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPP40O75818 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RPP40O75818 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPP40O75818 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPP40O75818 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPP40O75818 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPP40O75818 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPP40O75818 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPP40O75818 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPP40O75818 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPP40O75818 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPP40O75818 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RPP40O75818 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RPP40O75818 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPP40O75818 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPP40O75818 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPP40O75818 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPP40O75818 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPP40O75818 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPP40O75818 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPP40O75818 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPP40O75818 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPP40O75818 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPP40O75818 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPP40O75818 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPP40O75818 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPP40O75818 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPP40O75818 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPP40O75818 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPP40O75818 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPP40O75818 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPP40O75818 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPP40O75818 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPP40O75818 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPP40O75818 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPP40O75818 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPP40O75818 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPP40O75818 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPP40O75818 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPP40O75818 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPP40O75818 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPP40O75818 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPP40O75818 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RPP40O75818 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RPP40O75818 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RPP40O75818 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPP40O75818 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPP40O75818 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPP40O75818 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPP40O75818 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPP40O75818 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPP40O75818 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPP40O75818 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms