Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3BO75182 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3BO75182 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3BO75182 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIN3BO75182 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3BO75182 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIN3BO75182 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SIN3BO75182 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIN3BO75182 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIN3BO75182 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIN3BO75182 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3BO75182 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIN3BO75182 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIN3BO75182 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIN3BO75182 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3BO75182 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3BO75182 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3BO75182 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3BO75182 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3BO75182 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIN3BO75182 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3BO75182 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3BO75182 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3BO75182 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIN3BO75182 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3BO75182 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3BO75182 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SIN3BO75182 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIN3BO75182 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIN3BO75182 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIN3BO75182 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3BO75182 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3BO75182 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3BO75182 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3BO75182 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIN3BO75182 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIN3BO75182 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3BO75182 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3BO75182 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3BO75182 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3BO75182 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3BO75182 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3BO75182 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3BO75182 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3BO75182 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIN3BO75182 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3BO75182 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3BO75182 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3BO75182 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3BO75182 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3BO75182 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3BO75182 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3BO75182 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIN3BO75182 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3BO75182 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3BO75182 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3BO75182 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3BO75182 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3BO75182 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3BO75182 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3BO75182 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3BO75182 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3BO75182 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3BO75182 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3BO75182 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3BO75182 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3BO75182 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms