Protein–RNA interactions for Protein: O60906

SMPD2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD2O60906 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD2O60906 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD2O60906 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD2O60906 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD2O60906 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD2O60906 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD2O60906 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD2O60906 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD2O60906 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD2O60906 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD2O60906 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD2O60906 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD2O60906 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD2O60906 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD2O60906 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD2O60906 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD2O60906 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD2O60906 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD2O60906 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMPD2O60906 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD2O60906 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms