Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLOD3O60568 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLOD3O60568 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLOD3O60568 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLOD3O60568 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLOD3O60568 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLOD3O60568 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLOD3O60568 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLOD3O60568 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLOD3O60568 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLOD3O60568 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLOD3O60568 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLOD3O60568 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLOD3O60568 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLOD3O60568 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLOD3O60568 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLOD3O60568 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLOD3O60568 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLOD3O60568 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PLOD3O60568 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLOD3O60568 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLOD3O60568 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLOD3O60568 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLOD3O60568 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLOD3O60568 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLOD3O60568 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLOD3O60568 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLOD3O60568 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLOD3O60568 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PLOD3O60568 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLOD3O60568 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLOD3O60568 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLOD3O60568 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLOD3O60568 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PLOD3O60568 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PLOD3O60568 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLOD3O60568 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLOD3O60568 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLOD3O60568 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLOD3O60568 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLOD3O60568 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLOD3O60568 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLOD3O60568 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLOD3O60568 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLOD3O60568 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLOD3O60568 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLOD3O60568 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLOD3O60568 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLOD3O60568 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLOD3O60568 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLOD3O60568 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms