Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX15O60248 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX15O60248 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX15O60248 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX15O60248 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX15O60248 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX15O60248 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX15O60248 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX15O60248 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX15O60248 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX15O60248 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX15O60248 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX15O60248 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX15O60248 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX15O60248 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX15O60248 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX15O60248 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX15O60248 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX15O60248 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX15O60248 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX15O60248 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX15O60248 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX15O60248 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX15O60248 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX15O60248 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX15O60248 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX15O60248 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX15O60248 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX15O60248 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX15O60248 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX15O60248 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX15O60248 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX15O60248 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX15O60248 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX15O60248 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX15O60248 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX15O60248 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX15O60248 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX15O60248 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX15O60248 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX15O60248 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX15O60248 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX15O60248 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX15O60248 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX15O60248 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX15O60248 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX15O60248 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX15O60248 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX15O60248 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX15O60248 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX15O60248 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX15O60248 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX15O60248 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX15O60248 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX15O60248 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX15O60248 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX15O60248 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOX15O60248 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX15O60248 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX15O60248 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX15O60248 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX15O60248 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX15O60248 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SOX15O60248 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX15O60248 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX15O60248 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX15O60248 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX15O60248 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX15O60248 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX15O60248 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX15O60248 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX15O60248 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX15O60248 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX15O60248 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX15O60248 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SOX15O60248 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX15O60248 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX15O60248 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX15O60248 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX15O60248 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX15O60248 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX15O60248 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX15O60248 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX15O60248 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX15O60248 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX15O60248 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX15O60248 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX15O60248 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX15O60248 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX15O60248 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX15O60248 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX15O60248 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX15O60248 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX15O60248 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX15O60248 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX15O60248 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX15O60248 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX15O60248 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX15O60248 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX15O60248 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms