Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPRSS11DO60235 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPRSS11DO60235 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPRSS11DO60235 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS11DO60235 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS11DO60235 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPRSS11DO60235 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPRSS11DO60235 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPRSS11DO60235 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPRSS11DO60235 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPRSS11DO60235 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPRSS11DO60235 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPRSS11DO60235 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPRSS11DO60235 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPRSS11DO60235 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPRSS11DO60235 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPRSS11DO60235 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPRSS11DO60235 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPRSS11DO60235 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPRSS11DO60235 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS11DO60235 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS11DO60235 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS11DO60235 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms