Protein–RNA interactions for Protein: O60234

GMFG, Glia maturation factor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFGO60234 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GMFGO60234 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GMFGO60234 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GMFGO60234 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GMFGO60234 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GMFGO60234 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GMFGO60234 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GMFGO60234 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GMFGO60234 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GMFGO60234 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GMFGO60234 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GMFGO60234 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GMFGO60234 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GMFGO60234 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GMFGO60234 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GMFGO60234 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GMFGO60234 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GMFGO60234 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GMFGO60234 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GMFGO60234 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GMFGO60234 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GMFGO60234 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GMFGO60234 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GMFGO60234 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GMFGO60234 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GMFGO60234 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GMFGO60234 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GMFGO60234 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GMFGO60234 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GMFGO60234 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GMFGO60234 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GMFGO60234 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GMFGO60234 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GMFGO60234 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GMFGO60234 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GMFGO60234 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GMFGO60234 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GMFGO60234 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GMFGO60234 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GMFGO60234 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GMFGO60234 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GMFGO60234 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GMFGO60234 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GMFGO60234 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GMFGO60234 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GMFGO60234 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GMFGO60234 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GMFGO60234 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GMFGO60234 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GMFGO60234 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GMFGO60234 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GMFGO60234 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMFGO60234 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMFGO60234 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMFGO60234 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMFGO60234 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMFGO60234 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMFGO60234 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMFGO60234 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMFGO60234 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMFGO60234 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMFGO60234 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMFGO60234 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMFGO60234 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMFGO60234 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GMFGO60234 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMFGO60234 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMFGO60234 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMFGO60234 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GMFGO60234 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GMFGO60234 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GMFGO60234 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMFGO60234 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMFGO60234 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMFGO60234 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMFGO60234 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GMFGO60234 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GMFGO60234 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GMFGO60234 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMFGO60234 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMFGO60234 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMFGO60234 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMFGO60234 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMFGO60234 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMFGO60234 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMFGO60234 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GMFGO60234 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GMFGO60234 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GMFGO60234 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GMFGO60234 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GMFGO60234 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMFGO60234 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GMFGO60234 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GMFGO60234 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GMFGO60234 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GMFGO60234 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GMFGO60234 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GMFGO60234 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GMFGO60234 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GMFGO60234 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms