Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EDIL3O43854 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EDIL3O43854 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EDIL3O43854 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EDIL3O43854 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EDIL3O43854 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EDIL3O43854 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EDIL3O43854 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EDIL3O43854 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EDIL3O43854 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EDIL3O43854 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EDIL3O43854 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EDIL3O43854 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EDIL3O43854 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EDIL3O43854 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EDIL3O43854 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EDIL3O43854 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EDIL3O43854 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EDIL3O43854 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EDIL3O43854 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
EDIL3O43854 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
EDIL3O43854 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EDIL3O43854 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EDIL3O43854 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EDIL3O43854 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EDIL3O43854 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDIL3O43854 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
EDIL3O43854 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDIL3O43854 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDIL3O43854 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDIL3O43854 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDIL3O43854 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDIL3O43854 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDIL3O43854 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDIL3O43854 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDIL3O43854 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDIL3O43854 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EDIL3O43854 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EDIL3O43854 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EDIL3O43854 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EDIL3O43854 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EDIL3O43854 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EDIL3O43854 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EDIL3O43854 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EDIL3O43854 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EDIL3O43854 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EDIL3O43854 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EDIL3O43854 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDIL3O43854 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EDIL3O43854 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EDIL3O43854 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
EDIL3O43854 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EDIL3O43854 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EDIL3O43854 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms