Protein–RNA interactions for Protein: O43678

NDUFA2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA2O43678 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFA2O43678 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFA2O43678 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFA2O43678 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFA2O43678 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFA2O43678 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFA2O43678 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFA2O43678 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFA2O43678 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA2O43678 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA2O43678 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA2O43678 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFA2O43678 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA2O43678 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA2O43678 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFA2O43678 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA2O43678 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms