Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFSF14O43557 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF14O43557 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF14O43557 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFSF14O43557 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFSF14O43557 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFSF14O43557 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFSF14O43557 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFSF14O43557 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFSF14O43557 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFSF14O43557 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFSF14O43557 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFSF14O43557 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFSF14O43557 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFSF14O43557 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFSF14O43557 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFSF14O43557 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFSF14O43557 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFSF14O43557 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFSF14O43557 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFSF14O43557 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFSF14O43557 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFSF14O43557 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFSF14O43557 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFSF14O43557 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNFSF14O43557 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF14O43557 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF14O43557 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFSF14O43557 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFSF14O43557 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFSF14O43557 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFSF14O43557 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFSF14O43557 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF14O43557 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFSF14O43557 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFSF14O43557 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF14O43557 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF14O43557 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF14O43557 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms