Protein–RNA interactions for Protein: O43511

SLC26A4, Pendrin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A4O43511 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC26A4O43511 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC26A4O43511 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC26A4O43511 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC26A4O43511 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SLC26A4O43511 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC26A4O43511 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC26A4O43511 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC26A4O43511 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC26A4O43511 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC26A4O43511 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC26A4O43511 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC26A4O43511 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC26A4O43511 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC26A4O43511 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC26A4O43511 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC26A4O43511 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC26A4O43511 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC26A4O43511 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC26A4O43511 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC26A4O43511 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC26A4O43511 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC26A4O43511 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC26A4O43511 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SLC26A4O43511 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC26A4O43511 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC26A4O43511 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC26A4O43511 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC26A4O43511 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC26A4O43511 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC26A4O43511 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC26A4O43511 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC26A4O43511 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC26A4O43511 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC26A4O43511 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC26A4O43511 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC26A4O43511 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC26A4O43511 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC26A4O43511 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC26A4O43511 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC26A4O43511 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC26A4O43511 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC26A4O43511 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC26A4O43511 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC26A4O43511 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC26A4O43511 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC26A4O43511 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC26A4O43511 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC26A4O43511 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC26A4O43511 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC26A4O43511 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms