Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRID2O43424 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRID2O43424 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRID2O43424 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRID2O43424 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRID2O43424 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRID2O43424 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRID2O43424 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRID2O43424 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRID2O43424 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GRID2O43424 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRID2O43424 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRID2O43424 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRID2O43424 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRID2O43424 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRID2O43424 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GRID2O43424 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRID2O43424 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRID2O43424 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRID2O43424 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRID2O43424 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRID2O43424 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRID2O43424 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRID2O43424 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRID2O43424 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GRID2O43424 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GRID2O43424 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRID2O43424 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRID2O43424 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRID2O43424 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRID2O43424 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRID2O43424 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRID2O43424 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRID2O43424 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRID2O43424 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRID2O43424 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GRID2O43424 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRID2O43424 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRID2O43424 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRID2O43424 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRID2O43424 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRID2O43424 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRID2O43424 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRID2O43424 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GRID2O43424 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRID2O43424 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRID2O43424 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRID2O43424 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRID2O43424 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRID2O43424 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRID2O43424 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRID2O43424 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GRID2O43424 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GRID2O43424 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRID2O43424 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRID2O43424 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRID2O43424 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRID2O43424 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRID2O43424 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRID2O43424 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRID2O43424 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRID2O43424 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRID2O43424 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRID2O43424 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRID2O43424 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRID2O43424 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRID2O43424 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GRID2O43424 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRID2O43424 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRID2O43424 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRID2O43424 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRID2O43424 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRID2O43424 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRID2O43424 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRID2O43424 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRID2O43424 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRID2O43424 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GRID2O43424 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRID2O43424 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRID2O43424 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRID2O43424 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRID2O43424 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRID2O43424 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRID2O43424 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRID2O43424 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRID2O43424 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRID2O43424 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRID2O43424 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRID2O43424 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRID2O43424 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRID2O43424 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRID2O43424 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GRID2O43424 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRID2O43424 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRID2O43424 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRID2O43424 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRID2O43424 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRID2O43424 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRID2O43424 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRID2O43424 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms