Protein–RNA interactions for Protein: O43396

TXNL1, Thioredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1O43396 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXNL1O43396 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXNL1O43396 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms