Protein–RNA interactions for Protein: O43390

HNRNPR, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPRO43390 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HNRNPRO43390 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HNRNPRO43390 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HNRNPRO43390 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HNRNPRO43390 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HNRNPRO43390 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HNRNPRO43390 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HNRNPRO43390 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HNRNPRO43390 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HNRNPRO43390 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HNRNPRO43390 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HNRNPRO43390 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HNRNPRO43390 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HNRNPRO43390 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HNRNPRO43390 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HNRNPRO43390 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HNRNPRO43390 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HNRNPRO43390 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HNRNPRO43390 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HNRNPRO43390 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HNRNPRO43390 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HNRNPRO43390 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HNRNPRO43390 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HNRNPRO43390 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HNRNPRO43390 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HNRNPRO43390 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HNRNPRO43390 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPRO43390 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPRO43390 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPRO43390 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms