Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCP110O43303 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCP110O43303 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCP110O43303 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCP110O43303 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCP110O43303 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCP110O43303 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCP110O43303 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCP110O43303 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCP110O43303 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCP110O43303 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCP110O43303 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCP110O43303 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCP110O43303 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCP110O43303 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCP110O43303 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCP110O43303 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCP110O43303 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCP110O43303 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCP110O43303 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCP110O43303 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCP110O43303 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCP110O43303 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCP110O43303 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCP110O43303 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCP110O43303 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCP110O43303 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCP110O43303 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCP110O43303 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCP110O43303 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCP110O43303 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCP110O43303 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCP110O43303 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCP110O43303 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCP110O43303 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCP110O43303 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCP110O43303 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCP110O43303 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCP110O43303 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCP110O43303 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCP110O43303 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCP110O43303 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCP110O43303 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCP110O43303 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCP110O43303 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCP110O43303 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCP110O43303 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCP110O43303 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCP110O43303 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCP110O43303 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCP110O43303 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCP110O43303 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCP110O43303 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCP110O43303 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCP110O43303 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCP110O43303 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCP110O43303 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCP110O43303 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCP110O43303 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCP110O43303 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCP110O43303 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCP110O43303 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCP110O43303 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCP110O43303 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCP110O43303 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCP110O43303 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCP110O43303 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCP110O43303 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCP110O43303 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCP110O43303 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCP110O43303 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCP110O43303 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCP110O43303 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCP110O43303 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCP110O43303 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCP110O43303 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCP110O43303 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCP110O43303 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCP110O43303 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCP110O43303 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCP110O43303 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCP110O43303 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCP110O43303 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCP110O43303 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCP110O43303 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCP110O43303 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCP110O43303 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCP110O43303 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCP110O43303 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCP110O43303 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCP110O43303 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCP110O43303 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCP110O43303 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCP110O43303 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCP110O43303 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCP110O43303 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCP110O43303 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCP110O43303 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCP110O43303 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCP110O43303 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms