Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SART1O43290 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SART1O43290 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SART1O43290 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SART1O43290 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SART1O43290 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SART1O43290 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SART1O43290 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SART1O43290 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SART1O43290 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SART1O43290 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SART1O43290 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SART1O43290 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SART1O43290 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SART1O43290 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SART1O43290 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SART1O43290 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SART1O43290 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SART1O43290 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SART1O43290 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SART1O43290 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SART1O43290 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SART1O43290 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SART1O43290 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SART1O43290 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SART1O43290 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SART1O43290 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SART1O43290 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SART1O43290 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SART1O43290 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SART1O43290 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SART1O43290 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SART1O43290 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SART1O43290 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SART1O43290 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SART1O43290 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SART1O43290 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SART1O43290 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SART1O43290 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SART1O43290 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SART1O43290 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SART1O43290 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SART1O43290 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SART1O43290 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SART1O43290 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SART1O43290 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SART1O43290 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SART1O43290 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SART1O43290 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SART1O43290 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SART1O43290 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SART1O43290 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SART1O43290 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SART1O43290 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SART1O43290 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SART1O43290 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SART1O43290 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SART1O43290 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SART1O43290 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SART1O43290 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SART1O43290 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SART1O43290 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SART1O43290 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SART1O43290 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SART1O43290 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SART1O43290 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SART1O43290 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SART1O43290 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SART1O43290 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SART1O43290 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SART1O43290 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SART1O43290 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SART1O43290 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SART1O43290 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SART1O43290 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SART1O43290 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SART1O43290 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SART1O43290 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SART1O43290 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SART1O43290 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SART1O43290 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SART1O43290 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SART1O43290 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SART1O43290 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SART1O43290 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SART1O43290 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SART1O43290 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SART1O43290 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SART1O43290 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SART1O43290 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SART1O43290 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SART1O43290 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SART1O43290 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SART1O43290 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SART1O43290 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SART1O43290 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SART1O43290 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SART1O43290 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SART1O43290 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SART1O43290 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms