Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RGPD8O14715 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RGPD8O14715 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.45■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.45■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RGPD8O14715 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
RGPD8O14715 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RGPD8O14715 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RGPD8O14715 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
RGPD8O14715 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
RGPD8O14715 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RGPD8O14715 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RGPD8O14715 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
RGPD8O14715 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
RGPD8O14715 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
RGPD8O14715 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RGPD8O14715 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RGPD8O14715 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RGPD8O14715 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RGPD8O14715 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RGPD8O14715 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RGPD8O14715 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RGPD8O14715 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RGPD8O14715 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RGPD8O14715 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RGPD8O14715 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RGPD8O14715 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RGPD8O14715 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
RGPD8O14715 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RGPD8O14715 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RGPD8O14715 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RGPD8O14715 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RGPD8O14715 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RGPD8O14715 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RGPD8O14715 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RGPD8O14715 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RGPD8O14715 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RGPD8O14715 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RGPD8O14715 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RGPD8O14715 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RGPD8O14715 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RGPD8O14715 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RGPD8O14715 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RGPD8O14715 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RGPD8O14715 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
RGPD8O14715 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RGPD8O14715 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RGPD8O14715 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RGPD8O14715 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RGPD8O14715 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RGPD8O14715 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RGPD8O14715 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
RGPD8O14715 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RGPD8O14715 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RGPD8O14715 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RGPD8O14715 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RGPD8O14715 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RGPD8O14715 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RGPD8O14715 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RGPD8O14715 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RGPD8O14715 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RGPD8O14715 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RGPD8O14715 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RGPD8O14715 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RGPD8O14715 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RGPD8O14715 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms