Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TXNDC9O14530 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TXNDC9O14530 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TXNDC9O14530 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TXNDC9O14530 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms