Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
PTPRTO14522 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
PTPRTO14522 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PTPRTO14522 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
PTPRTO14522 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
PTPRTO14522 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PTPRTO14522 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PTPRTO14522 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PTPRTO14522 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
PTPRTO14522 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PTPRTO14522 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PTPRTO14522 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PTPRTO14522 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PTPRTO14522 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.76■■■■□ 3.96
PTPRTO14522 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PTPRTO14522 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PTPRTO14522 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PTPRTO14522 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PTPRTO14522 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
PTPRTO14522 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PTPRTO14522 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PTPRTO14522 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PTPRTO14522 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PTPRTO14522 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PTPRTO14522 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PTPRTO14522 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PTPRTO14522 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
PTPRTO14522 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PTPRTO14522 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PTPRTO14522 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
PTPRTO14522 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PTPRTO14522 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
PTPRTO14522 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PTPRTO14522 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PTPRTO14522 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PTPRTO14522 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PTPRTO14522 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
PTPRTO14522 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PTPRTO14522 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PTPRTO14522 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PTPRTO14522 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PTPRTO14522 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
PTPRTO14522 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PTPRTO14522 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PTPRTO14522 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PTPRTO14522 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PTPRTO14522 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PTPRTO14522 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PTPRTO14522 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRTO14522 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRTO14522 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRTO14522 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PTPRTO14522 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PTPRTO14522 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PTPRTO14522 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PTPRTO14522 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PTPRTO14522 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
PTPRTO14522 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PTPRTO14522 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PTPRTO14522 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PTPRTO14522 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PTPRTO14522 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PTPRTO14522 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PTPRTO14522 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PTPRTO14522 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PTPRTO14522 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
PTPRTO14522 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PTPRTO14522 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
PTPRTO14522 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
PTPRTO14522 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PTPRTO14522 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PTPRTO14522 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PTPRTO14522 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PTPRTO14522 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PTPRTO14522 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PTPRTO14522 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PTPRTO14522 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
PTPRTO14522 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PTPRTO14522 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
PTPRTO14522 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PTPRTO14522 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PTPRTO14522 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
PTPRTO14522 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
PTPRTO14522 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
PTPRTO14522 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
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