Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RNF103O00237 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF103O00237 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF103O00237 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF103O00237 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF103O00237 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF103O00237 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF103O00237 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF103O00237 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF103O00237 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF103O00237 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF103O00237 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF103O00237 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF103O00237 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF103O00237 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF103O00237 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF103O00237 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF103O00237 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF103O00237 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF103O00237 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF103O00237 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF103O00237 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF103O00237 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF103O00237 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF103O00237 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF103O00237 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF103O00237 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF103O00237 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF103O00237 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF103O00237 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF103O00237 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF103O00237 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF103O00237 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF103O00237 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF103O00237 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF103O00237 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RNF103O00237 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF103O00237 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF103O00237 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF103O00237 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF103O00237 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF103O00237 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF103O00237 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF103O00237 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF103O00237 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF103O00237 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF103O00237 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF103O00237 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF103O00237 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF103O00237 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF103O00237 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF103O00237 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF103O00237 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF103O00237 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF103O00237 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF103O00237 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF103O00237 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF103O00237 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF103O00237 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF103O00237 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF103O00237 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF103O00237 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF103O00237 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF103O00237 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF103O00237 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF103O00237 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF103O00237 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF103O00237 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF103O00237 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF103O00237 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF103O00237 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF103O00237 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF103O00237 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF103O00237 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF103O00237 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF103O00237 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF103O00237 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF103O00237 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF103O00237 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF103O00237 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF103O00237 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF103O00237 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF103O00237 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF103O00237 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF103O00237 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF103O00237 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF103O00237 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF103O00237 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF103O00237 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF103O00237 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF103O00237 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF103O00237 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF103O00237 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF103O00237 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF103O00237 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF103O00237 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF103O00237 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF103O00237 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF103O00237 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF103O00237 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms