Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H3BML4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BML4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BML4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BML4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BML4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BML4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BML4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BML4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BML4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BML4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BML4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BML4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BML4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BML4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BML4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BML4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BML4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BML4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BML4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BML4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BML4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BML4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BML4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BML4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
H3BML4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BML4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BML4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BML4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BML4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BML4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BML4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BML4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BML4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BML4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BML4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BML4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BML4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BML4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BML4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BML4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BML4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BML4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BML4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BML4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BML4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BML4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BML4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BML4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BML4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BML4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BML4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BML4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BML4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BML4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BML4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BML4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BML4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BML4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BML4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BML4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BML4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BML4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BML4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BML4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BML4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BML4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BML4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BML4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BML4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BML4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BML4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BML4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BML4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BML4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BML4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BML4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BML4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BML4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BML4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BML4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BML4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BML4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BML4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BML4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BML4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BML4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BML4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BML4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BML4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BML4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BML4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BML4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BML4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BML4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BML4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H3BML4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BML4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BML4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BML4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms