Protein–RNA interactions for Protein: H0YC42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H0YC42 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H0YC42 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H0YC42 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H0YC42 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H0YC42 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H0YC42 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H0YC42 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H0YC42 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
H0YC42 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H0YC42 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H0YC42 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
H0YC42 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H0YC42 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H0YC42 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
H0YC42 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H0YC42 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H0YC42 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H0YC42 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H0YC42 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H0YC42 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H0YC42 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H0YC42 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H0YC42 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H0YC42 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H0YC42 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
H0YC42 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H0YC42 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H0YC42 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
H0YC42 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H0YC42 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H0YC42 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H0YC42 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H0YC42 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H0YC42 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H0YC42 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H0YC42 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H0YC42 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H0YC42 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H0YC42 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
H0YC42 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H0YC42 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H0YC42 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H0YC42 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H0YC42 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H0YC42 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H0YC42 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H0YC42 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H0YC42 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H0YC42 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H0YC42 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H0YC42 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H0YC42 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H0YC42 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H0YC42 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H0YC42 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
H0YC42 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H0YC42 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H0YC42 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H0YC42 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H0YC42 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H0YC42 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H0YC42 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H0YC42 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H0YC42 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H0YC42 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H0YC42 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H0YC42 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H0YC42 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H0YC42 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H0YC42 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
H0YC42 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H0YC42 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H0YC42 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H0YC42 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H0YC42 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H0YC42 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H0YC42 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H0YC42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H0YC42 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H0YC42 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H0YC42 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H0YC42 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H0YC42 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H0YC42 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H0YC42 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H0YC42 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H0YC42 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H0YC42 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
H0YC42 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
H0YC42 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H0YC42 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H0YC42 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H0YC42 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H0YC42 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H0YC42 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H0YC42 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H0YC42 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H0YC42 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H0YC42 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H0YC42 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms