Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCRIP1C9JLW8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCRIP1C9JLW8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCRIP1C9JLW8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCRIP1C9JLW8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCRIP1C9JLW8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCRIP1C9JLW8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCRIP1C9JLW8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCRIP1C9JLW8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCRIP1C9JLW8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms