Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNCNA6PVL3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNCNA6PVL3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNCNA6PVL3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNCNA6PVL3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNCNA6PVL3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNCNA6PVL3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNCNA6PVL3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNCNA6PVL3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNCNA6PVL3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNCNA6PVL3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KNCNA6PVL3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms