Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GOLGA6L3A6NEY3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GOLGA6L3A6NEY3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GOLGA6L3A6NEY3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA6L3A6NEY3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA6L3A6NEY3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA6L3A6NEY3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA6L3A6NEY3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA6L3A6NEY3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA6L3A6NEY3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA6L3A6NEY3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA6L3A6NEY3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA6L3A6NEY3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA6L3A6NEY3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA6L3A6NEY3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA6L3A6NEY3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GOLGA6L3A6NEY3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GOLGA6L3A6NEY3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GOLGA6L3A6NEY3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GOLGA6L3A6NEY3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA6L3A6NEY3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA6L3A6NEY3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GOLGA6L3A6NEY3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA6L3A6NEY3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA6L3A6NEY3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA6L3A6NEY3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GOLGA6L3A6NEY3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA6L3A6NEY3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA6L3A6NEY3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA6L3A6NEY3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA6L3A6NEY3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA6L3A6NEY3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA6L3A6NEY3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA6L3A6NEY3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA6L3A6NEY3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA6L3A6NEY3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA6L3A6NEY3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA6L3A6NEY3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA6L3A6NEY3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA6L3A6NEY3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA6L3A6NEY3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GOLGA6L3A6NEY3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GOLGA6L3A6NEY3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GOLGA6L3A6NEY3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GOLGA6L3A6NEY3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GOLGA6L3A6NEY3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GOLGA6L3A6NEY3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GOLGA6L3A6NEY3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GOLGA6L3A6NEY3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GOLGA6L3A6NEY3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GOLGA6L3A6NEY3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GOLGA6L3A6NEY3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GOLGA6L3A6NEY3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GOLGA6L3A6NEY3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA6L3A6NEY3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA6L3A6NEY3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA6L3A6NEY3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA6L3A6NEY3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GOLGA6L3A6NEY3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GOLGA6L3A6NEY3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 533.6 ms