Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM247A6NEH6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM247A6NEH6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM247A6NEH6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM247A6NEH6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM247A6NEH6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM247A6NEH6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM247A6NEH6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM247A6NEH6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM247A6NEH6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM247A6NEH6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM247A6NEH6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM247A6NEH6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM247A6NEH6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM247A6NEH6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM247A6NEH6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM247A6NEH6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM247A6NEH6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM247A6NEH6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM247A6NEH6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM247A6NEH6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM247A6NEH6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM247A6NEH6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM247A6NEH6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM247A6NEH6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM247A6NEH6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM247A6NEH6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM247A6NEH6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM247A6NEH6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM247A6NEH6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM247A6NEH6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM247A6NEH6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM247A6NEH6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM247A6NEH6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM247A6NEH6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM247A6NEH6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM247A6NEH6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM247A6NEH6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM247A6NEH6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM247A6NEH6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM247A6NEH6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM247A6NEH6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM247A6NEH6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM247A6NEH6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM247A6NEH6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM247A6NEH6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM247A6NEH6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM247A6NEH6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms