Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB19A4D1S5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB19A4D1S5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB19A4D1S5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB19A4D1S5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB19A4D1S5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB19A4D1S5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB19A4D1S5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB19A4D1S5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB19A4D1S5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB19A4D1S5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB19A4D1S5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB19A4D1S5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB19A4D1S5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB19A4D1S5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB19A4D1S5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB19A4D1S5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB19A4D1S5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB19A4D1S5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB19A4D1S5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB19A4D1S5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB19A4D1S5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB19A4D1S5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB19A4D1S5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB19A4D1S5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB19A4D1S5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB19A4D1S5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB19A4D1S5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB19A4D1S5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB19A4D1S5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB19A4D1S5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB19A4D1S5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB19A4D1S5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB19A4D1S5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB19A4D1S5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB19A4D1S5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB19A4D1S5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms