Protein–RNA interactions for Protein: A1L157

TSPAN11, Tetraspanin-11, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11A1L157 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN11A1L157 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN11A1L157 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN11A1L157 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN11A1L157 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSPAN11A1L157 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSPAN11A1L157 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN11A1L157 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN11A1L157 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN11A1L157 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN11A1L157 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN11A1L157 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN11A1L157 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN11A1L157 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN11A1L157 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN11A1L157 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSPAN11A1L157 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSPAN11A1L157 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN11A1L157 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TSPAN11A1L157 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN11A1L157 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN11A1L157 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN11A1L157 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN11A1L157 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN11A1L157 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN11A1L157 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSPAN11A1L157 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TSPAN11A1L157 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSPAN11A1L157 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSPAN11A1L157 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSPAN11A1L157 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms