Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UBA6A0AVT1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBA6A0AVT1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBA6A0AVT1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBA6A0AVT1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBA6A0AVT1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBA6A0AVT1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBA6A0AVT1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBA6A0AVT1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBA6A0AVT1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBA6A0AVT1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBA6A0AVT1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBA6A0AVT1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBA6A0AVT1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBA6A0AVT1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBA6A0AVT1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBA6A0AVT1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBA6A0AVT1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBA6A0AVT1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBA6A0AVT1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBA6A0AVT1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBA6A0AVT1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBA6A0AVT1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms