Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX35

IGHV3-64D, Immunoglobulin heavy variable 3-64D, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms